La Casa de El Capitán está ubicada en la zona del casco conocida como El Calvario, manteniendo una historia estrechamente ligada a la familia que la edificó y que la utilizó como residencia a finales del siglo XIX, Los Alfonso. El Museo cuenta en la actualidad con siete salas. La Casa tiene un patio central con corredor utilizado para la muestra de diversas exposiciones, además de un patio trasero el cual es utilizado para la realización de ferias de artesanías y actos culturales varios. El Museo cuenta en la actualidad con un Aula de Alfarería Tradicional de San Miguel de Abona.